Белый дуб (Quercus alba), ценный с экономической, экологической и культурной точек зрения, является ключевым видом для лесов и одним из самых распространенных деревьев на большей части восточной части Северной Америки. Однако во многих частях ареала наблюдается снижение количества всходов этого вида.
В статье, опубликованной в New Phytologist, исследователи из Института сельского хозяйства Университета Теннесси, Университета Индианы, Университета Кентукки, Лесной службы США и ряда других учреждений впервые описывают сложный геном этого вида. Это дает представление об эволюции растений, селекции деревьев и усилиях по генетическому улучшению, которые могут помочь руководителям лесного хозяйства планировать и решать будущие лесные ресурсы.
Ведущие авторы статьи, Мэг Стейтон, доцент кафедры биоинформатики и вычислительной геномики факультета энтомологии и патологии растений Университета Теннесси, и Дрю Ларсон, научный сотрудник Национального научного фонда в Университете Индианы, координировали свои действия с коллегами по всей стране из научных кругов, Лесной службы США, государственных лесов и промышленности, чтобы получить данные о генетической последовательности, представляющие этот вид.
Сет ДеБолт, профессор садоводства и директор Института Кентукки Спиритс Джеймса Б. Бима в Университете Кентукки, и Дана Нельсон из Южной исследовательской станции Лесной службы США и директор Центра исследований и образования в области здоровья леса в Университете Кентукки, также сыграли центральную роль в этой работе.
Стейтон и ее соавторы отмечают, что геном белого дуба представляет собой новый важный ресурс для изучения разнообразия геномов и эволюции Quercus. Кроме того, непредвзятая аннотация генов является ключом к точной оценке эволюции генов R (устойчивости к болезням) у Quercus.
В статье рассматривается степень генетического разнообразия и дифференциации популяций Q. alba, а также то, как содержание генов и генов устойчивости к болезням, по-видимому, эволюционировало в ходе истории Quercus и родственных таксонов. Авторы также обсуждают филогенетические гипотезы – как виды дуба связаны эволюционно – что подтверждается данными полногеномного секвенирования.
В исследовании отмечается, что объем постоянной генетической изменчивости и степень адаптации популяций к местным условиям будут влиять на реакцию Q. alba и других видов белого дуба на все более распространенный тепловой и засушливый стресс. Подробности этого исследования представляют интерес для тех, кто заинтересован в устойчивости белого дуба в экономических, экологических и культурных границах.
